Bapperida Kota Cirebon menyelenggarakan layanan inovasi daerah dalam rangka mendorong pengembangan dan penerapan inovasi di lingkungan Pemerintah Kota Cirebon. Layanan ini mencakup fasilitasi, pembinaan, dan evaluasi inovasi daerah guna meningkatkan kualitas tata kelola pemerintahan, efektivitas pelayanan publik, serta daya saing pembangunan daerah.